动物检验检疫科
【科长】：韩春来
【副科长】：于鲲
【职 责】：负责跨省调运种用、乳用动物及胚胎、精液、种蛋的检疫审批；负责本市动物卫生监督检验工作；负责组织实施外埠进京动物及产品无疫安全专项与本市动物及动物产品安全检。

动物卫生监督科
【科长】：于宗振
【副科长】：鲍杰
【职 责】：负责组织实施产地检疫、屠宰检疫；负责组织实施公路运输检疫监督和治理公路“三乱”工作；负责组织实施动物卫生监督执法工作；负责重大的、跨区县的、突发的动物卫生监督违法案件的查处、督察；负责重大动物疫情扑灭和染疫动物无害化处理的监督；负责特需畜禽产品质量安全监管；负责组织实施流浪动物收容处理。

铁路运输检疫监督科
【科长】：王小军
【副科长】：康金立
【职 责】：负责接受全市经铁路运输的动物和动物产品的报检、报验，并实施检疫监督；负责铁路专运线5000吨以上级冷库的动物产品检疫监督工作。

航空运输检疫监督科
【科长】：张宁宁
【副科长】：刘洪亮
【职 责】：负责接受全市经航空运输的动物和动物产品的报检、报验，并实施检疫监督。

医政药政监督科
【科 长】：张莉
【副科长】：吴文鹏
【职 责】：承担兽药、动物诊疗及其相关的监督执法工作；负责涉兽药、动物诊疗及其相关的重大的、跨区县的、突发的违法案件的查处、督察；负责组织、实施农业部兽药残留监控计划、无公害食品行动计划和本市兽药残留监控计划。

畜牧饲料监督科
【科长】：谢磊
【副科长】：李艳
【职 责】：承担饲料、种畜禽及同畜牧法相关的监督执法工作；负责涉及饲料、种畜禽及同畜牧法相关的重大的、跨区县的、突发的违法案件的查处、督察。

综合科
【科 长】：吉鸿武
【副科长】：仇妍虹
【职 责】：负责全市动物卫生监督证章标志管理；承担全市动物卫生监督执法人员培训、管理和违规违纪的查处；负责本所科技项目工作；负责法律、法规、规范性文件的起草、修订工作；负责对行政执法案件的合法性审查和重大行政处罚案件集体讨论的组织；负责网站管理、业务统计及统计报表的汇总上报工作。

办公室 \人事劳资科
【主　任】：张琴（兼人事劳资科科长）
【副主任】：左春伟（兼人事劳资科副科长）、王可猛
【职 责】：负责所内外公文运转、重要文件和会议决定事项的督办和档案管理；负责本所人事、劳资、车辆、后勤保障和综合治理等工作；负责本所承担的审核、审批的相关工作；负责本所信息、宣传工作；负责突发重大动物疫情、公共卫生事件的紧急反应。

财务科
【职 责】：负责全所财务工作。